政府致力支持高等教育界的学术研究工作。在二零一七／一八学年，政府向大学教育资助委员会(教资会)资助大学、提供约88亿元研究经费。
教资会主要通过两个途径为大学的研究项目及活动提供经常拨款：(i)拨作研究用途的整笔补助金；以及(ii)研究资助局(研资局)以竞逐形式批出的研究用途补助金。整笔补助金内的研究用途拨款，主要用于确保大学配备合适的研究基础设施，藉提供教学人员、技术／支持人员及设备／资源，推动研究及研究主导的教学工作。至于研资局逐次批出的研究用途补助金，则用于资助整笔补助金不足以承担的大型研究项目。通过上述两个途径提供的支持，有助教资会资助大学的研究工作在各方面突飞猛进，更在多个领域开创先河。
有关研资局辖下各项拨款计划，详情载于该局网页https://www.ugc.edu.hk/chs/rgc/。
研究基金
为提高香港的研究能力和竞争力，政府在二零零九年拨款180亿元设立研究基金，再利用该基金赚取的投资收益，通过研资局向八所教资会资助大学提供稳定的研究拨款。二零一二年，政府向基金注资50亿元，为高等教育界提供更多研究资源，其中30亿元所带来的投资收益用作资助可颁授学位自资院校的研究项目。二零一八年，政府向基金额外注资30亿元，并以该笔资金带来的投资收益为修读教资会资助研究院研究课程的本地学生提供免入息审查学费豁免。
此外，立法会财务委员会在二零一九年六月批准向基金注资200亿元，为高等教育界大幅增加研究经费之余，亦确保经费来源稳定，以提升大学的研究能力，进一步推动卓越研究工作。注资带来的投资收益可用作：(i) 维持研究拨款水平；(ii) 为研资局推出的研究影响基金提供拨款，以持续资助具影响力的研究；以及(iii) 为研资局的协作研究拨款计划提供额外拨款，以鼓励跨院校／跨学科协作。
研究基金为研究用途补助金提供多一个稳定的拨款来源，亦资助教资会资助大学推动较长期并在策略上有利于香港发展的主题研究计划。
国家自然科学奖
由中华人民共和国国务院主办的「国家自然科学奖」是中国最高规格的自然科学奖项，旨在嘉许在自然科学基础及应用研究领域取得的优秀成果。自二零零零年起，教育局负责统筹该奖项在香港的提名工作，而研资局和京港学术交流中心均会提供协助。有关「国家自然科学奖」的详情，请浏览京港学术交流中心网站。
高等教育国家级教学成果奖
由中华人民共和国国务院主办的「国家级教学成果奖」每四年开展一次，表彰在教学中作出卓越贡献，有效提高教学水平和教育质量，取得显著成果的团体和教师。自二零一八年起，教育局负责统筹该奖项在香港的提名工作。
