政府致力支持高等教育界的學術研究工作。在二零一七／一八學年，政府向大學教育資助委員會(教資會)資助大學、提供約88億元研究經費。
教資會主要通過兩個途徑為大學的研究項目及活動提供經常撥款：(i)撥作研究用途的整筆補助金；以及(ii)研究資助局(研資局)以競逐形式批出的研究用途補助金。整筆補助金內的研究用途撥款，主要用於確保大學配備合適的研究基礎設施，藉提供教學人員、技術／支援人員及設備／資源，推動研究及研究主導的教學工作。至於研資局逐次批出的研究用途補助金，則用於資助整筆補助金不足以承擔的大型研究項目。通過上述兩個途徑提供的支援，有助教資會資助大學的研究工作在各方面突飛猛進，更在多個領域開創先河。
有關研資局轄下各項撥款計劃，詳情載於該局網頁http://www.ugc.edu.hk/big5/rgc/。
研究基金
為提高香港的研究能力和競爭力，政府在二零零九年撥款180億元設立研究基金，再利用該基金賺取的投資收益，通過研資局向八所教資會資助大學提供穩定的研究撥款。二零一二年，政府向基金注資50億元，為高等教育界提供更多研究資源，其中30億元所帶來的投資收益用作資助可頒授學位自資院校的研究項目。二零一八年，政府向基金額外注資30億元，並以該筆資金帶來的投資收益為修讀教資會資助研究院研究課程的本地學生提供免入息審查學費豁免。
此外，立法會財務委員會在二零一九年六月批准向基金注資200億元，為高等教育界大幅增加研究經費之餘，亦確保經費來源穩定，以提升大學的研究能力，進一步推動卓越研究工作。注資帶來的投資收益可用作：(i) 維持研究撥款水平；(ii) 為研資局推出的研究影響基金提供撥款，以持續資助具影響力的研究；以及(iii) 為研資局的協作研究撥款計劃提供額外撥款，以鼓勵跨院校／跨學科協作。
研究基金為研究用途補助金提供多一個穩定的撥款來源，亦資助教資會資助大學推動較長期並在策略上有利於香港發展的主題研究計劃。
國家自然科學獎
由中華人民共和國國務院主辦的「國家自然科學獎」是中國最高規格的自然科學獎項，旨在嘉許在自然科學基礎及應用研究領域取得的優秀成果。自二零零零年起，教育局負責統籌該獎項在香港的提名工作，而研資局和京港學術交流中心均會提供協助。有關「國家自然科學獎」的詳情，請瀏覽京港學術交流中心網站。
高等教育國家級教學成果獎
由中華人民共和國國務院主辦的「國家級教學成果獎」每四年開展一次，表彰在教學中作出卓越貢獻，有效提高教學水平和教育質量，取得顯著成果的團體和教師。自二零一八年起，教育局負責統籌該獎項在香港的提名工作。
