跨境校巴是指已获政府签发特别配额为跨境学童提供跨境接送服务的跨境巴士。有关跨境巴士营办商必须持有相关管制站的跨境巴士常规配额，方可提出特别配额的申请。
2024/25学年合资格乘坐跨境校巴的跨境学童如下：
文锦渡、香园围、深圳湾及落马洲（皇岗）管制站适用
在深圳居住及就读于全港各区幼稚园、小学或中学的跨境学童
港珠澳大桥香港口岸适用
在珠海居住及就读于全港各区幼稚园、小学或中学的跨境学童
有关跨境校巴的特别配额
政府每年均会重新审批跨境校巴特别配额的申请，一般会于每年5月至6月期间处理下学年的申请。家长应与学校及营办商保持紧密联系，以便及早知悉下学年交通安排。家长亦可浏览本网页，以了解相关的资讯。
2024/25学年获发特别配额的跨境校巴营办商资料（有效期至2025年7月）（排名不分先后）
管制站 | 跨境校巴营办商 | 联络电话 | 联络电话 （内地） |
|---|---|---|---|
深圳湾管制站 | 广东长虹旅游客运有限公司 | 6081 7305 | (+86) 139 2522 3492 |
深圳湾管制站 | 香港中旅汽车服务有限公司 | 6072 0219 2507 3977 | (+86) 138 2318 0922 |
| 深圳湾管制站 | 香港神鹿旅运发展有限公司 | 6072 0219 2507 3977 | (+86) 138 2318 0922 |
| 深圳湾管制站 | 香港南方贸易旅运有限公司 | 2399 0393 | - |
落马洲 | 快达香港豪华客车有限公司 | 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
文锦渡管制站 | 快达香港豪华客车有限公司 | 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
文锦渡管制站 | 利迅投资有限公司 | 9353 0200 6222 0991 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
| 文锦渡管制站 | 香港南方贸易旅运有限公司 | 2399 0393 | - |
香园围管制站 | 粤港汽车运输联营有限公司 | 6330 3396 | - |
港珠澳大桥 香港口岸 | 快达香港豪华客车有限公司 | 2230 3760 | (+86) 132 6697 5301 |
